DNA Oligo

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바이오니아는 2단계의 QC 과정을 통해 Dual Probe의 높은 효율을 보장합니다.
- 1차 MALDI-TOF QC: 정확한 제품 품질 확인을 위한 고급 질량 분석
- 2차 Filter Max5 QC: 형광량 측정으로 뛰어난 형광 프로브 성능 확인
100 mer 이상의 올리고에 형광 dye 수식이 필요하실 경우 문의 부탁드립니다. (order@bioneer.co.kr)
Sequencing, Cloning 실험용 primer는 PAGE 정제를 권장해 드립니다.

Priority [Standard/Next-day Oligo 특징]

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Comments [합성/분석 관련 요청사항]

DNA Oligomer Information [주문매뉴얼] [합성scale이란?] [Mixed Base Code] [TM Calculator] [이전 주문 검색]

Name

Sequence ( 5' -> 3' )

Scale

Purif

Add Modifications in a selected sequence input box	5' : 3' : Internal :
Add/Remove Rows
Additional Input Methods	① Copy & Paste : ② File Upload(Download Form) :

DNA Invoice Information

수량

제품 개요

개요

1992년 국내 벤처 1호 기업으로 설립된 바이오니아는 국내 최대의 DNA 및 RNA 합성회사로서 최고 품질의 올리고를 제공합니다. 바이오니아 DNA 합성 센터는 세계적인 합성능력을 보유하였으며 명실상부한 세계 최대의 유전자 합성회사로 거듭나기 위해 지속적으로 생산라인 확장 및 연구개발에 매진하고 있습니다. 독자 개발한 HT-Oligo^TM 384 합성기와 384 병렬 자동정제기 및 자동정량분주기 구축으로 하루에 30,500개 올리고를 합성할 수 있습니다.

바이오니아의 올리고 합성 서비스는 주문부터 합성, 검수, 포장까지 전 공정을 ‘Computer Aided Manufacturing (CAM) 시스템’에 의해 자동화함으로써 고품질의 올리고를 공급하고 있습니다. 특히 독자 개발한 Bio-RP 초고순도 정제 시스템은 고순도 올리고 생산을 가능하게 함으로써 PCR, sequencing 등의 일반적인 실험을 수행하는 연구기관 및 회사뿐 아니라 SNP typing, Gene Synthesis, DNAchip 등 다양한 응용분야를 수행하는 세계적인 연구기관 및 회사에도 당사 올리고 공급을 가능하게 하였습니다.

AccuOligo^®

Bioneer 에서 제공하는 모든 올리고는 상기 AccuOligo^® 시스템이 적용되며 모든 올리고는 Clean room에서 생산 함으로써 DNase, RNase, DNA Free한 상태로 고객 여러분께 공급되고 있습니다. 일반적으로 공급되는 올리고는 합성, 정제, QC, 분주 과정을 거처 건조된 후 고객에게 배송됩니다. 건조된 올리고는 운송 과정 중에 흔들림과 충격에 의해 튜브의 바닥에서 떨어져 나와 벽이나 뚜껑에 묻어 있게 되는데 이러한 상태로 그대로 개봉을 하게 되면 용기 내에서 이탈되어 손실이 발생할 수 있습니다.
Plate에 공급할 경우 더 심각하여 상호 교차오염이 발생할 수도 있습니다. 이런 경우에는 올리고의 농도가 맞지 않아 실험이 실패하게 됩니다.
바이오니아 연구진은 이러한 Oligo이탈 손실 문제를 해결하기 위해 심한 진동에서도 튜브바닥에서 떨어지지 않는AccuOligo®기술을 개발하였습니다.
(신규 건조 올리고뉴클레오티드 조성물' 특허 출원 2006 등록번호 제10-0777249호)

- 제조 또는 제품 포장 후 운송 중 Oligo 이탈/손실 방지

- 이탈 방지제는 PCR, Sequencing, Enzyme cutting 등에 전혀 영향이 없음

- 미량의 Oligo가 뚜껑에 부착되는 현상 극복

- Plate 내 각 well 간의 Contamination 방지

특장점

철저한 품질관리
총 7대의 MALDI-TOF Spectrometer를 사용하여 QC 전수 검사 시행합니다.
고품질의 올리고
독자 개발한 Bio-RP 초고순도 정제 시스템으로 n-1 mer를 포함한 Truncated Failures 제거. Clean Room에서 생산함으로써 DNase, RNase, DNA Free한 상태로 제공합니다.
정확한 농도
자동정량분주기와 배송 및 개봉 시 올리고의 손실을 방지하는 Accuoligo^® 기술을 이용하여 정확한 농도의 올리고 제공합니다.
자동화 생산
세계 최초로 자동화 생산 라인 공정 구축하여 주문부터 합성,QC,포장까지 전 공정을 ‘Computer Aided Manufacturing (CAM) 시스템’에 의해 자동화 생산됩니다.
대량생산능력
1일 30,500개의 합성 유전자 생산 가능합니다.
경제적인 가격
원재료 자체 생산으로 안정적인 납기와 품질의 균일성을 보장합니다.

◈ Manual

• Treatment for thiol modified oligonucleotides

• Anneal complementary pairs of oligonucleotides

◈ Primer Design Tool

• Primer Design (Primer3 기반으로 제공드리는 design tool 입니다. 실험 목적 및 조건에 맞춰 설정값을 조정한 후 사용하셔야 합니다.)

• TM Calculator

◈ MSDS

• MSDS_Oligos

◈ Brochure

• All about Bioneer's Custom Services

• FL_AccuEBQ^® Probes

• BR_Oligonucleotides Synthesis

◈ Quality Assurance

Bioneer is the holder of Quality Management System Certificates for the following standards.

• ISO 9001 – certificate

주문 정보

AccuEBQ^® Probes

▶ AccuEBQ^® Probes

바이오니아의 오랜 경험과 기술을 바탕으로 개발된 AccuEBQ^® Probes
25 base 이상의 긴 Probe에서도 실험으로 입증된 성능! 자신있게 추천합니다!

AccuEBQ^® Probes는 5’ Reporter Dye와 3' EBQ Quencher의 염기서열 중간(10~11번 사이)에 EBQ Quencher를 추가하여 25 base 이상의 긴 probe 에서도 형광 제어(dye quenching)의 효율성을 높인 제품입니다.

Dual Labeled Probes의 경우, 25 base 이상의 긴 Probe sequence로 디자인할 경우 형광 제어(dye quenching)의 효율성이 다소 떨어질 수 있습니다.
이러한 문제를 해결하기 위해 AccuEBQ® Probes는 Internal 위치에 EBQ Probes를 추가하여 5’ Reporter Dye와 3' Quencher의 거리를 단축시키고,
3' EBQ quencher와 함께 전체적으로 높은 형광제어(dye quenching)를 제공하여 qPCR 실험 시 background를 낮춰주고 signal detection을 증가시킵니다.

▶ 가격표

Modification			가격 (원) / 합성스케일 (nmole)					출고기간 (일)
5' Reporter Dye(s)	internal Quencher	Quencher	50	200	1,000	10,000	15,000	출고기간 (일)
Cyanine 3	i-EBQ (10~11 bp사이 권장)</P	EBQ	336,000	396,000	564,000	-	-	4 ~ 5
Cyanine 5			336,000	396,000	564,000	-	-	4 ~ 5
FAM			252,000	312,000	480,000	-	-	4 ~ 5
HEX			312,000	372,000	624,000	-	-	4 ~ 5
JOE			360,000	444,000	648,000	-	-	4 ~ 5
ROX			360,000	444,000	648,000	-	-	4 ~ 5
TAMRA			300,000	372,000	540,000	-	-	4 ~ 5
TET			312,000	372,000	624,000	-	-	4 ~ 5
Texas Red			360,000	444,000	648,000	-	-	4 ~ 5

▶ EBQ (Excellent Bioneer Quencher)

5’ Reporter Dye에 따라 사용해야 하는 Quencher를 고민하고 계신다면!
Quencher의 Total Solution인 EBQ quencher 하나로 해결할 수 있습니다!

EBQ(Excellent Bioneer Quencher)는 바이오니아에서 직접 개발한 새로운 개념의 Dark Quencher 화합물입니다.
기존의 Quencher보다 강하고 넓은 흡수영역을 가지고 있어 Dual Probe 영역에서 다양한 Reporter-Dye(fluorophore)를 효율적으로 Quenching 할 수 있습니다.
또한, 열 및 pH변화에도 안정한 구조를 가지고 있습니다. FAM부터 Cyanine5.5까지 커버 가능한 400~700nm의 넓은 흡수 파장영역 최대 570nm의 흡수 파장영역을 가지고 있어,
하나의 EBQ로 다양한 Reporter Dye를 효율적으로 Quenching할 수 있습니다.

Figure. EBQ로 형광제어(Quenching)가능한 Reporter-dye종류

▶ Combination of Dual Probe

Standard Oligonucleotide

▶ Standard Oligonucleotide

Standard oligonucleotide 합성 서비스는 130 mer 이하의 올리고 합성 서비스 입니다. 다양한 합성 스케일을 선택할 수 있으며 정제 방법 또한 용도에 따라 Bio-RP, HPLC 또는 PAGE 등 다양하게 선택 가능합니다.

▶ 가격표

합성 스케일 (nmole)	Base당 가격 (원)	합성가능한 base 수 (mer)	정제 (원)			보장량 (OD) 20base 기준			출고기간 (일)
합성 스케일 (nmole)	Base당 가격 (원)	합성가능한 base 수 (mer)	BioRP	PAGE	HPLC	BioRP	PAGE	HPLC	BioRP	PAGE	HPLC
25	450	15 - 34	무료	25,000	25,000	2	1	1.5	2	3	3
50	490	10 - 75	무료	25,000	25,000	4	2	2.5	2	3	3
200	1,000	5 - 110	무료	30,000	30,000	8	6	7	2	3	3
1,000	2,500	5 - 130	무료	40,000	40,000	30	18	25	2	3	3
10,000	20,000	5 - 50	무료	문의	문의	300	150	200	2	3	3
15,000	30,000	5 - 50	무료	문의	문의	문의	문의	문의	3	4	4

* Sequencing , Cloning 실험용 primer는 PAGE정제를 권장해 드립니다.

▶ 부가서비스 가격표

서비스 명	튜브 (원)	플레이트 (원)
농도 맞춤 서비스 - 기본	500	250 (well 당)
농도 맞춤 서비스 - 고객 맞춤	750	350 (well 당)
Bar-code Label	무료	무료
플레이트 분주 서비스	750	350 (well 당)
올리고 혼합 서비스	750	350 (well 당)
96Well 개별 튜브 라벨링	-	250 (well 당)
고객 맞춤 플레이트 서비스	-	10,000
Double strand (Annealing service)	20,000 / 쌍	-
MALDI-TOF (QC)	무료	무료
MALDI-TOF (SNP or Genotyping)	50,000	50,000 (well 당)
운송료	운송료가 부과될 수 있음	운송료가 부과될 수 있음
고객 맞춤형 base(A,C,G,T) 혼합 서비스	100,000 / (1~250 base)	50,000 / (1~250 base)
Circular ssDNA service	250,000 / sample	150,000 / sample

High Throughput

▶ HT-Oligo™

HT-Oligo™ 합성 서비스는 96개 이상의 올리고를 한 번에 주문하실 때 유용한 서비스이며 빠르고 합리적인 가격으로 올리고를 구매하실 수 있습니다.

▶ 가격표

합성 스케일 (nmole)	Base당 가격 (원)	합성가능한 base 수 (mer)	정제 (원)			보장량 (OD) 20base 기준			출고기간 (일)
합성 스케일 (nmole)	Base당 가격 (원)	합성가능한 base 수 (mer)	BioRP	PAGE	HPLC	BioRP	PAGE	HPLC	BioRP	PAGE	HPLC
25	300	15 - 34	무료	25,000	25,000	2	1	1.5	2	3	3
50	400	10 - 75	무료	25,000	25,000	4	2	2.5	2	3	3
200	700	5 - 110	무료	30,000	30,000	8	6	7	2	3	3
1,000	2,000	5 - 130	무료	40,000	40,000	30	18	25	2	3	3
10,000	15,000	5 - 50	무료	문의	문의	300	150	200	문의	문의	문의
15,000	20,000	5 - 50	무료	문의	문의	문의	문의	문의	문의	문의	문의

▶ 부가서비스 가격표

서비스 명	튜브 (원)	플레이트 (원)
농도 맞춤 서비스 - 기본	500	250 (well 당)
농도 맞춤 서비스 - 고객 맞춤	750	350 (well 당)
바코드 라벨링	무료	무료
플레이트 분주 서비스	750	350 (well 당)
올리고 혼합 서비스	750	350 (well 당)
96Well 개별 튜브 라벨링	-	250 (well 당)
고객 맞춤 플레이트 서비스	-	10,000
Double strand (Annealing service)	20,000 / 쌍	-
MALDI-TOF (QC)	무료	무료
MALDI-TOF (SNP or Genotyping)	50,000	50,000 (well 당)
운송료	운송료가 부과될 수 있음	운송료가 부과될 수 있음
고객 맞춤형 base(A,C,G,T) 혼합 서비스	100,000 / (1~250 base)	50,000 / (1~250 base)
Circular ssDNA service	250,000 / sample	150,000 / sample

Modified Oligos

▶ Modification Oligos

바이오니아의 축적된 연구 개발과 생산 노하우를 바탕으로 다양한 종류의 Modification 합성 서비스를 제공합니다. Real-Time PCR에 사용되는 다양한 Fluorescence Labeled Primer까지 250종류 이상의 Modification 서비스가 제공됩니다.

- 구조 : 3' 5' Internal

▶ 가격표

**표시는 상시 재고 보유 품목입니다.

품명	위치	합성 스케일 (nmole)
품명	위치	50	200	1000	10000	15000
**18 atom spacer	3'	50,000	60,000	80,000	240,000	400,000
	int	50,000	60,000	80,000	320,000	480,000
	5'	50,000	60,000	80,000	240,000	400,000
2',3'-ddA	3'
	int
	5'	180,000	220,000	330,000	3개 미만 (Set-up Charge:175,000)
2',3'-ddC	3'	125,000	150,000	220,000	3개 미만 (Set-up Charge:250,000)
	int
	5'	180,000	220,000	330,000	3개 미만 (Set-up Charge:175,000)
2',3'-ddG	3'
	int
	5'	180,000	220,000	330,000	3개 미만 (Set-up Charge:300,000)
2',3'-ddT	3'
	int
	5'	180,000	220,000	330,000	3개 미만 (Set-up Charge:175,000)
2,6-Diaminopurine	3'	315,000	350,000	550,000	3개 미만 (Set-up Charge:175,000)
	int	315,000	350,000	550,000	3개 미만 (Set-up Charge:175,000)
	5'	315,000	350,000	550,000	3개 미만 (Set-up Charge:175,000)
2-Aminopurine	3'	315,000	350,000	550,000	3개 미만 (Set-up Charge:175,000)
	int	315,000	350,000	550,000	3개 미만 (Set-up Charge:175,000)
	5'	315,000	350,000	550,000	3개 미만 (Set-up Charge:175,000)
2'-F-rA	3'	50,000	75,000	125,000	3개 미만 (Set-up Charge:175,000)
	int	50,000	75,000	125,000	3개 미만 (Set-up Charge:175,000)
	5'	50,000	75,000	125,000	3개 미만 (Set-up Charge:175,000)
2'-F-rC	3'	50,000	75,000	125,000	3개 미만 (Set-up Charge:175,000)
	int	50,000	75,000	125,000	3개 미만 (Set-up Charge:175,000)
	5'	50,000	75,000	125,000	3개 미만 (Set-up Charge:175,000)
2'-F-rG	3'	50,000	75,000	125,000	3개 미만 (Set-up Charge:175,000)
	int	50,000	75,000	125,000	3개 미만 (Set-up Charge:175,000)
	5'	50,000	75,000	125,000	3개 미만 (Set-up Charge:175,000)
2'-F-rU	3'	50,000	75,000	125,000	3개 미만 (Set-up Charge:175,000)
	int	50,000	75,000	125,000	3개 미만 (Set-up Charge:175,000)
	5'	50,000	75,000	125,000	3개 미만 (Set-up Charge:175,000)
2'-O-Methyl	3'	9,000	12,000	18,000	71,000	90,000
	int	9,000	12,000	18,000	71,000	90,000
	5'	9,000	12,000	18,000	71,000	90,000
3'-dA	3'	315,000	350,000	550,000	2,680,000	3,850,000
	int	315,000	350,000	550,000	2,680,000	3,850,000
	5'	315,000	350,000	550,000	2,680,000	3,850,000
3'-dC	3'	315,000	350,000	550,000	2,680,000	3,850,000
	int	315,000	350,000	550,000	2,680,000	3,850,000
	5'	315,000	350,000	550,000	2,680,000	3,850,000
3'-dG	3'	315,000	350,000	550,000	2,680,000	3,850,000
	int	315,000	350,000	550,000	2,680,000	3,850,000
	5'	315,000	350,000	550,000	2,680,000	3,850,000
3'-dT	3'	315,000	350,000	550,000	2,680,000	3,850,000
	int	315,000	350,000	550,000	2,680,000	3,850,000
	5'	315,000	350,000	550,000	2,680,000	3,850,000
5-F-dU	3'	90,000	110,000	350,000	3개 미만 (Set-up Charge:250,000)
	int	90,000	110,000	350,000	3개 미만 (Set-up Charge:250,000)
	5'	90,000	110,000	350,000	3개 미만 (Set-up Charge:250,000)
**Acrylamide (acrydite)	3'	90,000	110,000	350,000	1,500,000	2,100,000
	int
	5'	90,000	110,000	350,000	1,500,000	2,100,000
5-Nitroindole	3'	125,000	175,000	250,000	562,500	1,125,000
	int	125,000	175,000	250,000	562,500	1,125,000
	5'	125,000	175,000	250,000	562,500	1,125,000
AlexaFluor 488	3'	225,000	250,000	350,000	1,750,000	2,450,000
	int
	5'	225,000	250,000	350,000	1,750,000	2,450,000
AlexaFluor 647	3'	225,000	250,000	350,000	1,750,000	2,450,000
	int
	5'	225,000	250,000	350,000	1,750,000	2,450,000
**AMCA (amino-methyl-coumarin-acetate)	3'	125,000	175,000	275,000	3개 미만 (Set-up Charge: 175,000)
	int
	5'	125,000	175,000	275,000	3개 미만 (Set-up Charge: 175,000)
AminoOxy	3'
	int
	5'	125,000	150,000	220,000	550,000	650,000
Ara-dC	3'	90,000	110,000	350,000	3개 미만 (Set-up Charge:250,000)
	int	90,000	110,000	350,000	3개 미만 (Set-up Charge:250,000)
	5'	90,000	110,000	350,000	3개 미만 (Set-up Charge:250,000)
Atto 425	3'
	int
	5'	315,000	415,000	575,000	NA	NA
**Azide	3'	150,000	175,000	275,000	1,500,000	2,100,000
	int	150,000	175,000	275,000	1,500,000	2,100,000
	5'	150,000	175,000	275,000	1,250,000	2,100,000
Azobenzene	3'	125,000	175,000	250,000	1,250,000	NA
	int	125,000	175,000	250,000	1,250,000	NA
	5'	125,000	175,000	250,000	1,250,000	NA
**BHQ1	3'	125,000	150,000	220,000	660,000	1,100,000
	int
	5'	180,000	220,000	330,000	900,000	1,500,000
**BHQ2	3'	125,000	150,000	220,000	660,000	1,100,000
	int
	5'	180,000	220,000	330,000	900,000	1,500,000
**Biotin	3'	65,000	80,000	140,000	420,000	720,000
	int
	5'	40,000	50,000	120,000	360,000	600,000
**Biotin-TEG	3'	90,000	110,000	150,000	510,000	850,000
	int	90,000	110,000	150,000	510,000	850,000
	5'	90,000	110,000	150,000	510,000	850,000
BromoHexyl (Br)	3'
	int
	5'	150,000	175,000	275,000	1,500,000	2,100,000
**C12 spacer	3'	50,000	60,000	80,000	240,000	400,000
	int	50,000	60,000	80,000	320,000	480,000
	5'	50,000	60,000	80,000	240,000	400,000
**C6 spacer	3'	50,000	60,000	80,000	240,000	400,000
	int	50,000	60,000	80,000	320,000	480,000
	5'	50,000	60,000	80,000	240,000	400,000
**C12-Amine	3'
	int
	5'	75,000	90,000	125,000	375,.000	625,000
**C6 Amine	3'	30,000	40,000	60,000	180,000	300,000
	int
	5'	20,000	30,000	50,000	150,000	250,000
**C3-Amine	3'
	int
	5'	50,000	60,000	80,000	240,000	400,000
C2 Aldehyde	3'
	int
	5'	225,000	250,000	350,000	660,000	1,100,000
C6-Psoralen	3'
	int
	5'	225,000	250,000	350,000	NA	NA
C8-Alkyne-dC	3'	150,000	175,000	275,000	650,000	750,000
	int	150,000	175,000	275,000	650,000	750,000
	5'	150,000	175,000	275,000	650,000	750,000
C8-Alkyne-dT	3'	150,000	175,000	275,000	650,000	750,000
	int	150,000	175,000	275,000	650,000	750,000
	5'	150,000	175,000	275,000	650,000	750,000
dT-Alkyne	3'	225,000	250,000	350,000	1,750,000	2,450,000
	int
	5'	225,000	250,000	350,000	1,750,000	2,450,000
Cholesteryl	3'	90,000	110,000	350,000	1,500,000	2,100,000
	int
	5'
Cholesterol	3'	90,000	110,000	350,000	1,500,000	2,100,000
	int
	5'	90,000	110,000	350,000	1,500,000	2,100,000
Cholesterol-TEG	3'	120,000	150,000	350,000	1,650,000	2,310,000
	int
	5'	120,000	150,000	350,000	1,650,000	2,310,000
**Cyanine 3	3'	150,000	175,000	250,000	1,250,000	2,450,000
	int
	5'	150,000	175,000	250,000	1,250,000	2,450,000
Cyanine 3.5	3'	225,000	250,000	350,000	1,750,000	2,450,000
	int
	5'	225,000	250,000	350,000	1,750,000	2,450,000
**Cyanine 5	3'	150,000	175,000	250,000	1,250,000	2,450,000
	int
	5'	150,000	175,000	250,000	1,250,000	2,450,000
**Cyanine 5.5	3'	225,000	250,000	350,000	1,750,000	2,450,000
	int
	5'	225,000	250,000	350,000	1,750,000	2,450,000
**Dabcyl	3'	120,000	150,000	220,000	660,000	1,100,000
	int
	5'	220,000	250,000	350,000	1,750,000	2,450,000
**Deoxy Uridine	3'
	int	9,000	12,000	18,000	71,000	90,000
	5'
Deoxypurine (2'-DeoxyNebu larine)	3'	75,000	90,000	125,000	3개 미만 (Set-up Charge: 250,000)
	int	75,000	90,000	125,000	3개 미만 (Set-up Charge: 250,000)
	5'	75,000	90,000	125,000	3개 미만 (Set-up Charge: 250,000)
DBCO	3'	180,000	220,000	330,000	900,000	NA
	int
	5'	180,000	220,000	330,000	900,000	NA
DBCO-TEG	3'
	int
	5'	216,000	264,000	396,000	990,000	NA
**DIG	3'	150,000	175,000	250,000	1,250,000	2,450,000
	int
	5'	150,000	175,000	250,000	1,250,000	2,450,000
Desthiobiotin TEG	3'	150,000	175,000	275,000	750,000	875,000
	int	150,000	175,000	275,000	750,000	875,000
	5'	150,000	175,000	275,000	750,000	875,000
**Dithiol	3'	180,000	220,000	330,000	1,500,000	2,100,000
	int	180,000	220,000	330,000	1,500,000	2,100,000
	5'	180,000	220,000	330,000	1,500,000	2,100,000
DNP (2,4-dinitrophenyl)-TEG	3'	125,000	175,000	275,000	3개 미만 (Set-up Charge:175,000)
	int	125,000	175,000	275,000	3개 미만 (Set-up Charge:175,000)
	5'	125,000	175,000	275,000	3개 미만 (Set-up Charge:175,000)
dSpacer	3'	65,000	80,000	140,000	700,000	980,000
	int	65,000	80,000	140,000	700,000	980,000
	5'	65,000	80,000	140,000	700,000	980,000
**EBQ	3'	112,500	135,000	198,000	594,000	990,000
	int
	5'
EDTA-C2-dT	3'	120,000	150,000	275,000	3개 미만 (Set-up Charge:250,000)
	int	120,000	150,000	275,000	3개 미만 (Set-up Charge:250,000)
	5'	120,000	150,000	275,000	3개 미만 (Set-up Charge:250,000)
Epoch Eclips Quencher	3'	225,000	250,000	350,000	1,750,000	2,450,000
	int	225,000	250,000	350,000	1,750,000	2,450,000
	5'	225,000	250,000	350,000	1,750,000	2,450,000
**FAM	3'	70,000	90,000	160,000	480,000	800,000
	int
	5'	70,000	90,000	160,000	480,000	800,000
**Ferrocene-dT	3'
	int	180,000	200,000	300,000	1,500,000	2,100,000
	5'
GalNac	3'
	int
	5'	420,000	450,000	700,000	3,200,000	4,500,000
**HEX	3'
	int
	5'	90,000	110,000	300,000	1,500,000	2,100,000
**Hexynyl	3'
	int
	5'	60,000	70,000	100,000	500,000	700,000
Inverted dT (A,C,G,T)	3'	45,000	60,000	95,000	350,000	700,000
	int
	5'
**Inosine	3'	8,000	10,000	20,000	60,000	100,000
	int	8,000	10,000	20,000	60,000	100,000
	5'	8,000	10,000	20,000	60,000	100,000
**JOE	3'
	int
	5'	180,000	220,000	330,000	900,000	1,500,000
**Maleimide	3'	50,000	65,000	95,000	350,000	700,000
	int
	5'	50,000	65,000	95,000	350,000	700,000
Methylene Blue	3'	180,000	220,000	330,000	3개 미만 (Set-up Charge: 250,000)
	int	225,000	250,000	350,000	3개 미만 (Set-up Charge: 250,000)
	5'	180,000	222,000	330,000	3개 미만 (Set-up Charge: 250,000)
N3-Methyl dC	3'	150,000	175,000	275,000	650,000	750,000
	int	150,000	175,000	275,000	650,000	750,000
	5'	150,000	175,000	275,000	650,000	750,000
N4-Ethyl dC	3'	150,000	175,000	275,000	650,000	750,000
	int	150,000	175,000	275,000	650,000	750,000
	5'	150,000	175,000	275,000	650,000	750,000
N6-methyl- 2'-deoxyadenosine	3'	120,000	150,000	220,000	3개 미만 (Set-up Charge:175,000)
	int	90,000	110,000	350,000	3개 미만 (Set-up Charge:250,000)
	5'	120,000	150,000	220,000	3개 미만 (Set-up Charge:175,000)
O4-Methyl-dT	3'	75,000	90,000	125,000	375,000	625,000
	int	75,000	90,000	125,000	375,000	625,000
	5'	75,000	90,000	125,000	375,000	625,000
O6-Methyl 2'-dG	3'	75,000	90,000	125,000	375,000	625,000
	int	75,000	90,000	125,000	375,000	625,000
	5'	75,000	90,000	125,000	375,000	625,000
PC(photo-cleavable) Linker	3'
	int	120,000	150,000	275,000	3개 미만 (Set-up Charge:250,000)
	5'
PC(photo-cleavable) Amine Linker	3'
	int	120,000	150,000	275,000	3개 미만 (Set-up Charge:250,000)
	5'	120,000	150,000	275,000	3개 미만 (Set-up Charge:250,000)
PC(photo-cleavable) Biotin Linker	3'
	int	120,000	150,000	275,000	3개 미만 (Set-up Charge:250,000)
	5'	120,000	150,000	275,000	3개 미만 (Set-up Charge:250,000)
Perylene-dU	3'	150,000	175,000	275,000	650,000	750,000
	int	150,000	175,000	275,000	650,000	750,000
	5'	150,000	175,000	275,000	650,000	750,000
**Phosphate	3'	30,000	40,000	60,000	180,000	300,000
	int
	5'	20,000	30,000	50,000	150,000	250,000
**Phosphorothioate	3'
	int	3,000	4,500	7,500	37,500	52,500
	5'
Puromycine	3'	125,000	150,000	300,000	1,500,000	2,100,000
	int
	5'
Pyrene-Cap	3'
	int
	5'	225,000	250,000	350,000	1,750,000	2,450,000
Pyrene-dU	3'	150,000	175,000	275,000	650,000	750,000
	int	150,000	175,000	275,000	650,000	750,000
	5'	150,000	175,000	275,000	650,000	750,000
**Rhodamine 6G	3'	225,000	250,000	350,000	1,750,000	2,450,000
	int
	5'	225,000	250,000	350,000	1,750,000	2,450,000
**ROX	3'	180,000	220,000	330,000	900,000	1,500,000
	int
	5'	180,000	220,000	330,000	900,000	1,500,000
Serinol Amine	3'
	int	120,000	150,000	220,000	660,000	1,100,000
	5'
Spacer 9	3'
	int	65,000	80,000	140,000	420,000	720,000
	5'
**TAMRA	3'	120,000	150,000	220,000	660,000	1,100,000
	int
	5'	120,000	150,000	220,000	660,000	1,100,000
**TET	3'
	int
	5'	125,000	150,000	300,000	1,500,000	2,100,000
**Texas Red	3'	180,000	220,000	330,000	900,000	1,500,000
	int
	5'	180,000	220,000	330,000	900,000	1,500,000
**Thiol	3'	150,000	180,000	250,000	750,000	1,250,000
	int
	5'	125,000	150,000	220,000	660,000	1,100,000
Thymidine Glycol	3'	150,000	175,000	275,000	3개 미만 (Set-up Charge:175,000)
	int	150,000	175,000	275,000	3개 미만 (Set-up Charge:175,000)
	5'	150,000	175,000	275,000	3개 미만 (Set-up Charge:175,000)
**triphosphate	3'
	int
	5'	475,000	600,000	675,000	1,350,000	NA
Trebler Branching	3'
	int	220,000	250,000	350,000	1,750,000	2,450,000
	5'
Yakima Yellow	3'	120,000	150,000	275,000	3개 미만 (Set-up Charge: 250,000)
	int
	5'	250,000	275,000	350,000	3개 미만 (Set-up Charge: 250,000)
Zebularine	3'	75,000	90,000	125,000	3개 미만 (Set-up Charge:250,000)
	int	75,000	90,000	125,000	3개 미만 (Set-up Charge:250,000)
	5'	75,000	90,000	125,000	3개 미만 (Set-up Charge:175,000)
3'-Inverted dA	3'	45,000	60,000	95,000	350,000	700,000
	int
	5'
3'-Inverted dC	3'	45,000	60,000	95,000	350,000	700,000
	int
	5'
3'-Inverted dG	3'	45,000	60,000	95,000	350,000	700,000
	int
	5'
Acridine	3'
	int
	5'	125,000	175,000	275,000	3개 미만 (Set-up Charge: 250,000)
4-thio-dT	3'
	int	225,000	250,000	350,000	1,750,000	NA
	5'
5-Br-dC	3'
	int	150,000	180,000	250,000	1,250,000	NA
	5'
5-Bromo dU	3'
	int	70,000	90,000	160,000	800,000	1,120,000
	5'
5-Hydroxy-dU	3'
	int	145,000	175,000	240,000	680,000	3개 미만 (Set-upCharge: 250,000)
	5'
5-hydroxymethyl-dC	3'
	int	180,000	200,000	300,000	1,500,000	3개 미만 (Set-upCharge: 250,000)
	5'
5-hydroxymethyl-dU	3'
	int	145,000	175,000	240,000	680,000	3개 미만 (Set-upCharge: 250,000)
	5'
5-Methyl dC	3'
	int	60,000	75,000	110,000	330,000	770,000
	5'
6-thio-dG	3'
	int	225,000	250,000	350,000	1,750,000	NA
	5'
8-Br-dA	3'
	int	150,000	180,000	250,000	1,250,000	NA
	5'
8-Br-dG	3'
	int	150,000	180,000	250,000	1,250,000	NA
	5'
8-Oxo-dA	3'
	int	150,000	180,000	250,000	1,250,000	1,750,000
	5'
8-Oxo-dG	3'
	int	150,000	180,000	250,000	1,250,000	1,750,000
	5'
Cyanine 3 dA	3'
	int	250,000	275,000	420,000	1,950,000	2,750,000
	5'
Cyanine 3 dC	3'
	int	250,000	275,000	420,000	1,950,000	2,750,000
	5'
Cyanine 3 dG	3'
	int	250,000	275,000	420,000	1,950,000	2,750,000
	5'
Cyanine 3 dT	3'
	int	225,000	250,000	350,000	1,750,000	2,450,000
	5'
Cyanine 5 dA	3'
	int	250,000	275,000	420,000	1,950,000	2,750,000
	5'
Cyanine 5 dC	3'
	int	250,000	275,000	420,000	1,950,000	2,750,000
	5'
Cyanine 5 dG	3'
	int	250,000	275,000	420,000	1,950,000	2,750,000
	5'
Cyanine 5 dT	3'
	int	225,000	250,000	350,000	1,750,000	2,450,000
	5'
OMe-dT	3'
	int
	5'	75,000	95,000	150,000
**LNA(A,C,G,T)	3'	50,000	75,000	125,000	1,250,000
	int	50,000	75,000	125,000	1,250,000
	5'	50,000	75,000	125,000	1,250,000
**L-DNA(A,C,G,T)	3'	125,000	175,000	250,000	1,250,000
	int	125,000	175,000	250,000	1,250,000
	5'	125,000	175,000	250,000	1,250,000
Pyrrolo-dC	3'
	int	250,000	275,000	385,000	1,950,000
	5'
**2'-MOE(A,C,G,U)	3'	20,000	25,000	45,000	75,000	100,000
	int	20,000	25,000	45,000	75,000	100,000
	5'	20,000	25,000	45,000	75,000	100,000
**BHQ1-dT	3'	275,000	300,000	380,000	1,750,000	2,450,000
	int	275,000	300,000	380,000	1,750,000	2,450,000
	5'	275,000	300,000	380,000	1,750,000	2,450,000
BHQ2-dT	3'	400,000	450,000	700,000	2,680,000	3,850,000
	int	400,000	450,000	700,000	2,680,000	3,850,000
	5'	400,000	450,000	700,000	2,680,000	3,850,000
**Biotin-dT	3'	180,000	220,000	330,000	1,500,000	2,100,000
	int	180,000	220,000	330,000	1,500,000	2,100,000
	5'	180,000	220,000	330,000	1,500,000	2,100,000
**C6 Amine-dT	3'	150,000	180,000	250,000	1,250,000	1,750,000
	int	150,000	180,000	250,000	1,250,000	1,750,000
	5'	150,000	180,000	250,000	1,250,000	1,750,000
Cyanine7	3'
	int
	5'	290,000	325,000	455,000	590,000
**Dabcyl-dT	3'	315,000	350,000	550,000	2,680,000	3,850,000
	int	315,000	350,000	550,000	2,680,000	3,850,000
	5'	315,000	350,000	550,000	2,680,000	3,850,000
**FAM-dT	3'	220,000	250,000	350,000	1,750,000	2,450,000
	int	220,000	250,000	350,000	1,750,000	2,450,000
	5'	220,000	250,000	350,000	1,750,000	2,450,000
i-EBQ	3'
	int	112,500	123,500	157,500	787,500	1,023,750
	5'
**HEX-dT	3'
	int	250,000	275,000	385,000	1,750,000	2,450,000
	5'
**Tamra-dT	3'	220,000	250,000	350,000	1,750,000	2,450,000
	int	220,000	250,000	350,000	1,750,000	2,450,000
	5'	220,000	250,000	350,000	1,750,000	2,450,000
**Thiol-dT	3'	225,000	250,000	350,000	1,750,000	2,450,000
	int	225,000	250,000	350,000	1,750,000	2,450,000
	5'	225,000	250,000	350,000	1,750,000	2,450,000
**NED	3'
	int
	5'	168,000	279,000	407,000	문의	문의
**VIC	3'
	int
	5'	187,000	310,000	452,000	문의	문의

이외의 Modification 올리고 합성 여부는 바이오니아 기술진에 문의하여 주십시오.

Modification 올리고는 4~5일 이내(근무일 기준) 발송됩니다. QC결과 및 원재료의 재고상황에 따라 납기가 달라질 수 있습니다.

Dual Labeled Probes

▶ Dual Labeled Probe

바이오니아의 Dual Labeled Probe는 일반적으로 5'쪽에 Reporter를 3'쪽에Quencher를 붙여 제작한 것으로 Real-Time PCR에 사용됩니다. 다양한 형광 물질을 붙여 사용함으로써 한 번에 여러 개의 유전자를 검색하는 Multiplex Analysis도 가능합니다. 바이오니아의 Dual Labeled Probe는 MALDI-TOF Mass Spectrometer QC 방법 및 Fluoroskan을 이용한 형광 테스트를 수행함으로써 고품질을 보장합니다.

▶ 가격표

Modification	가격 (원) / 합성스케일 (nmole) ( 10~35Base로 디자인 된 Dual Probe에 한정 )					출고기간 (일)
Modification	50	200	1,000	10,000	15,000	출고기간 (일)
5'-FAM-3'-MGB	468,000	909,000	1,315,000	문의	문의	10 ~ 15
5'-VIC-3'-MGB	468,000	909,000	1,315,000	문의	문의	10 ~ 15
5'-VIC-3'-TAMRA	468,000	909,000	1,315,000	문의	문의	10 ~ 15
5'-Cyanine 3-3'-BHQ1	290,000	350,000	490,000	2,100,000	3,600,000	4 ~ 5
5'-Cyanine 3-3'-BHQ2	290,000	350,000	490,000	2,100,000	3,600,000	4 ~ 5
5'-Cyanine 3-3'-EBQ	280,000	330,000	470,000	2,100,000	3,600,000	4 ~ 5
5'-Cyanine 5-3'-BHQ2	290,000	370,000	490,000	2,100,000	3,600,000	4 ~ 5
5'-Cyanine 5-3'-EBQ	280,000	330,000	470,000	2,100,000	3,600,000	4 ~ 5
5'-FAM-3'-BHQ1	220,000	270,000	420,000	1,500,000	2,300,000	4 ~ 5
5'-FAM-3'-BHQ2	220,000	270,000	420,000	1,500,000	2,300,000	4 ~ 5
5'-FAM-3'-DABCYL	210,000	270,000	420,000	1,500,000	2,300,000	4 ~ 5
5'-FAM-3'-EBQ	210,000	260,000	400,000	1,500,000	2,200,000	4 ~ 5
5'-FAM-3'-TAMRA	210,000	270,000	420,000	1,500,000	2,300,000	4 ~ 5
5'-FAM-BHQ1-dT-Amine-3'	360,000	420,000	610,000	2,800,000	4,050,000	4 ~ 5
5'-FAM-Tamra-dT-PO4-3'	330,000	400,000	610,000	2,800,000	4,100,000	4 ~ 5
5'-HEX-3'-BHQ1	270,000	320,000	530,000	2,300,000	3,400,000	4 ~ 5
5'-HEX-3'-BHQ2	270,000	320,000	530,000	2,300,000	3,400,000	4 ~ 5
5'-HEX-3'-DABCYL	260,000	320,000	530,000	2,300,000	3,400,000	4 ~ 5
5'-HEX-3'-EBQ	260,000	310,000	520,000	2,300,000	3,300,000	4 ~ 5
5'-HEX-3'-TAMRA	260,000	320,000	530,000	2,300,000	3,400,000	4 ~ 5
5'-JOE-3'-BHQ1	320,000	390,000	560,000	1,900,000	2,900,000	4 ~ 5
5'-JOE-3'-BHQ2	320,000	390,000	560,000	1,900,000	2,900,000	4 ~ 5
5'-JOE-3'-DABCYL	310,000	390,000	560,000	1,900,000	2,900,000	4 ~ 5
5'-JOE-3'-EBQ	300,000	370,000	540,000	1,800,000	2,800,000	4 ~ 5
5'-JOE-3'-TAMRA	310,000	390,000	560,000	1,900,000	2,900,000	4 ~ 5
5'-ROX-3'-BHQ1	320,000	390,000	560,000	1,900,000	2,900,000	4 ~ 5
5'-ROX-3'-BHQ2	320,000	390,000	560,000	1,900,000	2,900,000	4 ~ 5
5'-ROX-3'-EBQ	300,000	370,000	540,000	1,800,000	2,800,000	4 ~ 5
5'-TAMRA-3'-BHQ1	260,000	320,000	470,000	1,700,000	2,600,000	4 ~ 5
5'-TAMRA-3'-BHQ2	260,000	320,000	470,000	1,700,000	2,600,000	4 ~ 5
5'-TAMRA-3'-DABCYL	260,000	320,000	470,000	1,700,000	2,600,000	4 ~ 5
5'-TAMRA-3'-EBQ	250,000	310,000	450,000	1,600,000	2,500,000	4 ~ 5
5'-TET-3'-BHQ1	270,000	320,000	530,000	2,300,000	3,400,000	4 ~ 5
5'-TET-3'-BHQ2	270,000	320,000	530,000	2,300,000	3,400,000	4 ~ 5
5'-TET-3'-DABCYL	260,000	320,000	530,000	2,300,000	3,400,000	4 ~ 5
5'-TET-3'-EBQ	260,000	310,000	520,000	2,300,000	3,300,000	4 ~ 5
5'-TET-3'-TAMRA	260,000	320,000	530,000	2,300,000	3,400,000	4 ~ 5
5'-Texas Red-3'-BHQ1	320,000	390,000	560,000	1,900,000	2,900,000	4 ~ 5
5'-Texas Red-3'-BHQ2	320,000	390,000	560,000	1,900,000	2,900,000	4 ~ 5
5'-Texas Red-3'-EBQ	300,000	370,000	540,000	1,800,000	2,800,000	4 ~ 5

▶ Spectra of Fluorescent Dyes

Dye	Excitation max (nm)	Exitinction Coefficient (L/mole.Cm)	Emission max (nm)
6-FAM	494	83,000	520
BHQ-1	534	34,000	-
BHQ-2	579	38,000	-
Cyanine 3	546	150,000	563
Cyanine 3.5	581	150,000	596
Cyanine 5	646	250,000	662
Cyanine 5.5	675	250,000	694
Cyanine 7	743	250,000	767
DABCYL	478	32,000	-
Fluorescein-dT	494	83,000	522
HEX	535	73,000	553
IR700	685	170,000	705
IR800	787	200,000	807
JOE	529	71,000	555
NED	546	-	575
Rhodamine 6G	524	116,000	550
ROX	588	82,000	608
TAMRA	556	91,000	580
TET	521	73,000	541
Texas Red	598	116,000	617
VIC	538	-	554

참고: UV/Visible spectra of the variety of dyes and quenchers currently available

이외의 Dual probe 올리고 합성 여부는 바이오니아 기술진에 문의하여 주십시오.

Extendamers™

▶ Extendamers™
Extendamers™(Long Oligonucleotides) 합성 서비스는 130 ~ 200 base에 이르는 긴 길이의 올리고를 합성해 드리는 서비스 입니다. 합성된 Long Oligonucleotide는 PAGE 방식을 통해 정제합니다. Extendamers™는 Cloning, shRNA, Gene Construction등의 용도로 적합하며, 전체 Target Fragment를 합성함으로써 Application 중 발생하는 에러를 줄일 수 있고, 많은 비용과 시간을 절약 할 수 있습니다.

▶ 가격표

Base당 가격
(원) 합성가능한 base수
(mer) 보장량
(nmole) 출고기간
(일)

1,600 130 - 200 0.25 ~ 0.3 7 ~ 8

▶ Modification 가격표

Modification 가격 (원)

5'-Phosphate 30,000

5'-Biotin 50,000

5'-Amine 30,000

5'-Fluorescein 90,000

5'-Tamra 150,000

Inosine 10,000

130mers 이상의 올리고는 Extendamers ™ (Long Oligonucleotides)의 합성 가격이 적용됩니다.

기타 문의 사항은 바이오니아 기술진에 문의하여 주십시오.
Large Scale

▶ Large Scale
Large Scale Oligonucleotide (Bulk Oligo)는 15 umol scale이상의 올리고 합성 서비스 입니다. 자체 개발한 Bulk 올리고용 합성기로 mg 단위에서 kg 스케일의 올리고 합성이 가능하며, Antisense 연구 및 Decoy, RNAi 올리고 등 대용량 scale의 연구에 필요한 올리고 합성기술과 특수 정제 기술을 확보하고 있습니다.

▶ DNA 가격표

공급량 (mg) 가격 (원) 가격 (원)

BioRp HPLC

50 1,500,000 1,800,000

100 1,750,000 2,100,000

250 2,400,000 2,600,000

500 4,200,000 4,400,000

1,000 6,600,000 6,800,000

▶ S-DNA 가격표 (Phosphorothioate)

공급량 (mg) 가격 (원) 가격 (원)

BioRp HPLC

50 2,100,000 2,350,000

100 2,500,000 2,700,000

250 3,350,000 3,600,000

500 5,750,000 6,150,000

1,000 8,500,000 9,500,000

▶ RNA 가격표

공급량 (mg) 가격 (원) 가격 (원)

BioRp HPLC

50 1,950,000 2,340,000

100 2,275,000 2,730,000

250 3,120,000 3,380,000

500 5,460,000 5,720,000

1,000 8,580,000 8,840,000

▶ S-RNA 가격표 (Phosphorothioate)

공급량 (mg) 가격 (원) 가격 (원)

BioRp HPLC

50 2,750,000 3,000,000

100 3,250,000 3,500,000

250 4,350,000 4,650,000

500 7,500,000 8,000,000

1,000 11,000,000 12,500,000

기타 문의 사항은 바이오니아 기술진에 문의하여 주십시오.

▶ Contact Us

㈜바이오니아 올리고 생산부

TEL : 1588 - 9788 or 042 - 930 - 8574

FAX : 042 - 930 - 8700

E-mail : oligo-support@bioneer.com

자주 묻는 질문들

▶ 취급 및 보관

올리고는 어떻게 보관하며 얼마나 오래 가나요?

일반적으로 올리고는 –20℃에서 1년 이상 안정합니다.

올리고를 받으신 후에 장기간 사용하시려면, clean bench에서 공기 중의 bio-particle이 들어가지 않도록 주의하여 여러 개의 DNAse- free tube에 분주하여 보관하시며 하나씩 꺼내어 사용하시어야 합니다. 특히 RNA oligo는 공기 중의 bio-particle에 의해 더 쉽게 분해되므로 사용 시에 clean bench에서 뚜껑을 열고 사용하시기 바랍니다. 참고로, 바이오니아의 모든 올리고는 clean room에서 제조되기 때문에 실험실의 bio-particle에 의한 오염이 되지 않으면 장기간 보존이 가능합니다.

일반적으로 DNA는 Fe 이온 같은 미량의 중금속 이온에 의해서도 서서히 분해와 침전이 일어나기 때문에 멸균 증류수에 녹이는 것보다 TE (10 mM Tri-HCl (pH 8.0), 0.1 mM EDTA) Buffer에 녹여두시면 더 오래 보관할 수 있습니다.

Storage Condition	Shelf Life (Month)
at RT in water	2
at 4℃ in water	9
at -20℃ in water	18
at -20℃ (Dry)	24

* 품질 보증기간: 주문 후 6개월 이내 (–20℃ 이하 보관 조건)

건조된 올리고는 어떤 Buffer로 용해시키나요?

건조 상태로 제공되는 올리고를 용해할 때 Buffer에 과량의 Salt(Na⁺, K⁺ 등)가 포함되어 있으면 PCR 반응 시 inhibitor로 작용하여 PCR 반응을 저해시킬 수 있습니다.
TE Buffer 및 DEPC-D.W, Ultra-pure water 등을 이용하여 용해하기를 권장합니다. (PBS Buffer 사용 불가)

또한, 건조된 올리고는 물에 잘 녹지만 올리고의 특이한 sequence에 의해 형성된 구조로 인해 간혹 잘 녹지 않는 경우가 있습니다. 해당 경우에는 60~70℃ water bath에 10~15분간 incubation 시킨 후 vortex하여 centrifuge후 사용합니다.

• DNA(Molecular Weight: 6025)를 Buffer별로 희석 후 측정 결과 [측정 장비: MALDI-TOF MASS)

1. TE-Buffer, DEPC-D.W를 사용하여 희석한 DNA

- Main 분자량(6025) 대비 ±0.6% 범위의 Main peak(6018.6)와 Half peak(3013.2)만 측정됨을 확인.
- 정상적으로 측정되는 올리고는 MALDI-TOF MASS 장비의 특성상 Main peak와 half peak 2가지가 측정됩니다.

2. PBS Buffer를 사용하여 희석한 DNA

- Main 분자량(6025) 대비 ±0.6% 범위에 속한 Main peak(6025.6)이 측정되었지만 과량의 Salt peak이 같이 측정됨을 확인.
- 과량의 Salt가 존재하여 PCR 반응을 저해 시키는 결과가 나오게 됩니다.

올리고 용액을 상온에서 일주일 이상 방치했는데 괜찮을까요?

앞서 언급하였듯이 공기중의 bio-particle 이 오염되지 않았다면 큰 문제는 없습니다. 오염으로 인한 가수분해가 의심이 되는 경우에는 당사에 MALDI-TOF 분석을 의뢰할 수 있습니다.

Fluorescent dye modified 올리고는 어떻게 보관해야 하나요?

유기형광염료는 빛에 노출되면 서서히 분해가 됩니다. 올리고에 붙인 형광염료도 일반적인 실험실의 빛에 의해서도 서서히 분해가 되므로, 차광이 되는 용기에 넣어서 빛이 들어오지 않는 장소에 보관하시길 권장합니다.

Preferred TE Buffer for Reconstitution & storage pH for Fluorescent Probes
6-FAM, HEX, TET, ROX, TAMRA	TE Buffer pH 7.5 or 8.0
Cyanine3, Cyanine3.5, Cyanine5, Cyanine5.5	TE Buffer pH 7.0 or 7.5
Cyanine dyes rapidly degrade in acidic pH

▶ 정량 및 농도

올리고의 O.D. 값은 무엇을 의미하나요?

합성된 올리고는 sequence에 따라 올리고가 가지고 있는 고유의 흡광계수를 이용하여 빛의 흡광도를 측정하여 정량을 하게 되는데 이때 빛의 흡수량을 O.D. (Optical density) 값으로 표시합니다.

합성 올리고의 양을 O.D. 값으로부터 어떻게 얻어내나요?

합성 올리고를 파장 260 nm 의 UV Light 에서 O.D. 값을 측정한 뒤 다음과 같은 수식을 이용하여 합성된 올리고의 양을 얻어냅니다.

O.D. = εC

수식에서 ε (Extinction Coefficient)은 물질이 빛을 흡수하는 정도를 나타내는 상수로 물질에 따라 고유한 값을 가지며 C 는 올리고의 농도를 의미합니다. 올리고는 sequence에 따른 고유의 ε값을 계산할 수 있는 수식이 알려져 있어서 각각의 올리고에 해당하는 ε값을 구할 수 있습니다. 그러므로 O.D. 값을 측정하면 상기의 수식에 적용하여 용액의 Concentration, 즉 올리고의 몰농도를 알 수 있게 됩니다.

올리고의 ε 값은 260 nm UV Light에서 각 base의 Extinction Coefficient 값의 (표 1) 합으로 계산하는 방법과 base 간의 sequence 간섭에 의한 차이를 고려한 Extinction Coefficient 값의 (표 2) 합으로 계산하는 방법이 있습니다.

[Unit : L/mole.cm]

표1)

dA	15,400
dC	7,400
dG	11,500
dT	8,700

표2)

	dA	dC	dG	dT
dA	27,400	21,200	25,000	22,800
dC	21,200	14,600	18,000	15,200
dG	25,200	17,600	21,600	20,000
dT	23,400	16,200	19,000	16,800

다음과 같이 올리고 (3G, 4C, 5A, 6T / GGGCCCCAAAAATTTTTT) 18 mer의 전체 O.D. 값이 0.7 이었다면 올리고의 양은 얼마나 되나요?

올리고의 양은 흡광 계수 (Extinction Coefficient)를 구하는 방법에 따라 다음과 같이 계산됩니다.

• 위 문항의 (표1)에 의한 흡광 계수 (Extinction Coefficient)

= G의 염기개수 * 11500 + C의 염기개수 * 7400 + A의 염기개수 * 15400 + T의 염기개수 * 8700

= 11500 x 3 + 7400 x 4 + 15400 x 5 + 8700 x 6 = 193.3 (mL/mole)

따라서O.D. = εC에 대입하여 계산하면

C = 0.7 /193.3 = 0.003621 (mmole/mL) = 3.6 (nmole/mL)이 된다.

• 위 문항의 (표2)에 의한 흡광 계수 (Extinction Coefficient)

= (GG + GG + GC + CC + CC + CC + CA + AA + AA + AA + AA + AT + TT + TT + TT + TT + TT) - (G + G + C + C + C + C + A + A + A + A + A + T + T + T + T + T)

= (21600 + 21600 + 17600 + 14600 + 14600 + 14600 + 21200 + 27400 + 27400 + 27400 + 27400 + 22800 + 16800 + 16800 + 16800 + 16800 + 16800)

- (11500 + 11500 + 7400 + 7400 + 7400 + 7400 + 15400 + 15400 + 15400 + 15400 + 15400 + 8700 + 8700 + 8700 + 8700 + 8700)

= (342,200) - (173,100)

= 169,100 (mL/mmole)

따라서O.D. = εC에 대입하여 계산하면

C = 0.7 /169,100 = 0.000004139562 (mmole/mL) = 4.14 (nmole/mL)가 된다.

자사에서는 (표2)에 의한 방법을 도입하여 적용하고 있으며, 이 결과는 Oligo Q.C Report 상의 'Total nmole' 수치로 나타납니다.

합성 올리고의 분자량 (Molecular Weight) 측정은 어떻게 하나요?

다음의 수식에 각 base 의 수를 대입하여 계산합니다.

M.W. =(NA x 249.2) + (NC x 225.2) + (NG x 265.2) + (NT x 240.2) + ((oligolength-1) x 63.98) + 2.02

NA = Total number of A

NC = Total number of C

NG = Total number of G

NT = Total number of T

합성 Scale의 umole 단위를 ng 단위로 변환하는 방법은 어떻게 되나요?

일반적으로 올리고의 합성 scale은 umole단위로 신청되며 합성된 결과도 보통 nmole단위로 report됩니다.

하지만, 사용하고자 하실 때 ng 또는 ug 단위로 하신다면 mole을 g으로 환산하시면 됩니다.

Report에 올리고의 분자량이 표시되기 때문에 쉽게 바꿀 수 있습니다.

분자량 M.W (g/mole) X mole 수 (nmole) = 올리고의 양 (ng)

합성 올리고의 농도 맞추는 방법에 대한 설명

올리고 QC 리포트의 'volume for 100 pmole/ul' 의 의미는, 건조된 올리고를 녹일 때 농도를 100 pmole/ul의 농도로 맞추기 위해 첨가해야 할 TE buffer나 D.W의 양을 의미합니다.

예를 들어

첨부된 올리고 QC 리포트에 189 라고 적혀 있다면, oligo tube에 D.W or TE-Buffer를 189 ul 첨가했을 때 농도가 100 pmole/ul가 된다는 것입니다. 이때 tube에 들어있는 oligo의 mole 수는 189.0 ul x 100 pmole/ul = 18,900 pmole = 18.9 nmole, 들어 있습니다.

사용하시는 목적에 따라 primer의 농도를 알맞게 설정하여야 하지만, 일반적으로 PCR이나 sequencing의 경우 많은 실험 protocol 들이 100 pmole/ul 농도를 사용하기 때문에, 당사에서는 100 pmole/ul 농도로 만들기 위한 volume을 제공하고 있습니다.

50 nmole scale로 주문했는데 합성량이 그 보다 적은 이유는 무엇인가요?

50 nmole scale 합성의 의미는 합성 출발물질의 양을 50 nmole로 하여 합성을 시작한다는 것을 의미합니다. 따라서 합성 및 정제된 최종 올리고의 양은 항상 50 nmole 보다 적은 양이 얻어집니다. 올리고의 길이가 30 mer이고 한 염기를 붙이는 합성효율(coupling efficiency)이 평균 98%일때 0.98²⁹ = 0.56 이고 탈보호기 반응과 정제과정에서 약 50% 이하의 수율로 얻어지므로 최종수율은 28%인 14 nmole 정도로 얻어집니다.

염기서열이 길어질수록 base coupling 및 deprotection, purification 수율이 급격히 떨어지므로 길이가 긴 올리고의 경우 최종 올리고는 5 nmole 이하로 얻어집니다.

긴 올리고는 정량 하기가 어려운데 어떻게 정확하게 측정할 수 있을까요?

긴 올리고는 self-hybridization으로 인한 hypochromicity 로 base의 extinction coefficient 를 기반으로 계산한 값보다 낮은 흡광도를 가지게 됩니다. 온도를 올려서 OD를 측정하면 이러한 현상을 줄일 수 있지만 강한 self-hybridization 을 하고 있는 경우에는 측정값이 실제 농도보다 적을 수 있습니다. 이 경우 temperature scanning spectrophotometer 를 사용하면 정확한 농도와 더불어 Melting temperature 도 측정할 수 있습니다. 당사에서는 유료로 분석서비스를 제공하고 있으니 문의하시기 바랍니다.

Molarity와 mole의 단위변환

농도의 단위는 M (mole/L)을 사용합니다. 유전자 실험에서 아주 적은 양의 올리고를 합성해서 사용하므로, u (micro), n (nano), p (pico) 등의 저농도의 단위들을 주로 사용합니다. 이 단위들에 대해서는 다음을 참조하시기 바랍니다.

10^-1 = deci [d]

10^-2 = centi [c]

10^-3 = milli [m]

10^-6 = micro [u]

10^-9 = nano [n]

10^-12 = pico [p]

10^-15 = femto [f]

-----------------------------------------

1 pmole/ul = 1x10^-12 mole / 1x10^-6 L = 1x10^-6 mole / L = 1 umole/ L = 1 uM

이므로, uM과 pmole/ul는 같은 단위가 됩니다. 그러므로 저희가 제공하는 올리고 QC 시트에 적힌 양으로 올리고를 녹였을 때, 올리고 농도는 100 uM 입니다.

본인이 계산한 올리고의 Tm 값과 바이오니아에서 제공한 Tm 값이 차이가 나는 이유는 무엇인가요?

바이오니아에서 사용하는 Tm calculator는 일반적으로 A, G, C, T의 갯 수에 일정 값을 곱하기 하는 단순한 계산 방식과는 다른 것으로서 A, G, C, T의 배열 순서에 따라서 Tm값은 차이가 나게 됩니다. 왜냐하면 한 염기의 앞뒤로 인접한 염기들에 따라 hybridization 강도가 영향을 받기 때문입니다. 그러므로 전체 염기서열의 A, G, T, C 각각의 염기 수가 같은 2개의 올리고도, sequence가 다르면 Tm은 다르게 됩니다. 올리고 이중나선의 안정성은 pH와 salt 농도에 의해서도 크게 영향을 받습니다.특정 pH와 salt 농도에서의 정확한 Tm값은 temperature scanning spectrophotometer 를 사용하여 측정할 수 있습니다. 당사에서는 유료로 분석서비스를 제공하고 있으니 문의하시기 바랍니다.

Degenerated primer와 universal primer의 정의에 대해 알고 싶습니다.

Degenerated primer는 primer의 특정 base 위치에 한 개 이상의 염기서열을 가지고 있는 primer 를 의미합니다. 예를 들어, A라는 종(species)에서 a라는 gene의 sequence가 5'-gga ttc ggg ccc gag tct-3' 이고, B라는 종에서는 5'-ggc ttc ggg ccc gaa tct-3' 이라고 가정한다면, 2개의 gene을 모두 포함하는 sequence는 5'-gg(a/c) ttc ggg ccc ga(g/a) tct-3' 이라고 예측할 수 있습니다. (즉, 3번째 염기는 adenine이나 cytosine, 15번째 염기는 guanine이나 adenine) 이와 같은 경우, 이 유전자에 해당하는 degenerate primer는 5'-ggM ttc ggg ccc gaR tct-3' 가 됩니다. 즉, degenerated primer는 sequence의 변이를 고려하여 모든 sequence에 binding할 수 있도록 하나의 위치에 두 가지 이상의 base가 섞여 있는 primer를 말합니다. 이때 합성된 올리고가 포함하고 있는 올리고의 종류 수는 mixed base가 여러 군데 들어가는 경우 각각의 mixed base의 곱하기가 됩니다. 상기예의 경우는, 두 위치에 각각 두 가지의 base가 있으므로 모두 4종류의 sequence가 섞여 있는 primer 혼합물이 됩니다.

Universal primer는 plasmid등에 공통적으로 들어 있는 sequence를 의미합니다. Cloning작업에서 많이 사용되는 plasmid들은 대부분 pBR322 계열을 기반으로 하여 M13 bacteriophage의 sequence를 이용하여 조금씩 변형된 것들입니다. 예를 들면, T7 promoter나 SP6 promoter, T7 terminator, 혹은 M13 forward/reverse 등입니다. 이런 공통된 sequence에 binding할 수 있도록 design된 것들이 universal primer입니다. 보통 universal primer를 이용하여 vector에 삽입된 DNA fragment를 sequencing합니다.

▶ Modified Oligo

Modified Oligo의 종류와 구조를 알고 싶습니다.

올리고의 다양한 응용을 위해서는, 자연계의 DNA, RNA 구조와 다른 modified된 올리고가 필요합니다. 올리고를 modification하기 위해서는 (deoxy)ribose ring을 변형하는 것, base를 변형하는 것, phosphodiester 결합을 바꾸는 것, 5’이나 3’ 말단에 conjugate 를 붙이는 여러가지 방법이 가능합니다. 이러한 모든 변형방법은 phosphoramidite 방법을 이용하여 올리고 합성기를 통해 변형 올리고를 합성할 수 있습니다.

올리고의 5’ 위치에 modification이 필요한 경우는 정해진 염기배열의 올리고 합성이 완료된 후 label phosphoramidite를 사용하여 5’ 위치에 결합시킴으로써 올리고의 5’ 위치에 label이 부착됩니다.

3’-Modification의 경우는 label이 미리 부착된 고형 지지체로부터 올리고의 합성을 수행하여 3’ 위치에 label이 부착된 올리고를 합성할 수 있게 됩니다.

Deoxyuridine base의 5번 탄소 위치에 label을 도입한 phosphoramidite를 이용하면 올리고 합성 시 원하는 sequence 중간에 label을 도입할 수 있어 결과적으로 internal modified 올리고의 합성이 가능하게 됩니다. Modification oligo 종류와 구조는 당사 홈페이지를 참고하시기 바랍니다.

▶ 합성 방법

합성된 올리고에는 5’ 또는 3’ 위치에 phosphate가 붙어있습니까?

주문하실 때 별도로 지시하지 않으면 5' 과 3' 위치에는 -OH 기가 붙어있습니다. 따라서 5' phosphate가 부착된 올리고를 원하시면 5' phosphorylation modification된 올리고를 주문하셔야 합니다.

G가 여러 개 반복되는 올리고를 합성할 수 있을까요?

G가 여러 개 반복되는 올리고는 합성에 상당히 어려움이 있습니다.
G가 4개이상 반복되면 guanine tetraplex (Poon and MacGregor (198) Biopolymers 45:427-434)형태로 aggregation되기 쉽기 때문입니다. 이때는 Inosine을 몇 개의 G대신 첨가하여 aggregation을 방지할 수 있습니다. 저희 바이오니아 는 오랜 합성 경험을 통해 얻은 기술로 10 연속 G가 포함된 올리고도 큰 어려움 없이 합성해 오고 있습니다.

올리고는 어떻게 합성되는지 알고 싶습니다.

Oligonucleotide 합성기에서 가장 보편적으로 사용되는 합성방법은 Koster에 의해 개발된 cyanoethyl phosphoramidite를 이용하여 DNA 구조의 골격을 이루는 phosphodiester 결합을 연결해가는 ‘phosphite triester’ 방법이다(Nucl. Acids Res. 1984, 12, 4539; Tetrahedron Lett. 1983, 24,5843). 이를 통해 짧은 시간에 Oligonucleotide를 높은 효율로 합성할 수 있으며 (합성효율: >98%) 합성 시 사용되는 phosphoramidite monomer는 coupling을 위해 활성화되기 전에는 상당히 안정되어 있어 장기 보관도 가능합니다.

합성 과정은 nucleoside가 부착된 고형지지체로부터 시작하여 deblocking, coupling, oxidation, capping 과정으로 이루어지는 cycle 을 반복함으로써 원하는 염기서열의 Oligonucleotide를 얻게 된다. <그림 1 참조>

(1) Deblocking

합성 cycle의 첫 단계인 deblocking 과정은 고형지지체에 붙어 있는 염기의 5’OH의 보호기인 DMT기를 떼어내는 반응으로, 산성 조건이 요구되어 보통 3% trichloroacetic acid 를 사용한다. 한편 산성 조건 하에서는 purine계열 염기와 sugar ring 사이의 결합이 끊어지는 depurination 반응이 일어날 수 있으며 특히 염기가 adenosine 인 경우에는 그 경향이 더 심할 수 있다고 보고되었다. Trichloroacetic acid 는 매우 강한 산으로 (pKa : ~1.5) deblocking 에 사용할 때 depurination 시킬 가능성이 있어 너무 오랫동안 deblocking 반응을 하지않도록 주의가 요구된다. 상기의 문제점을 최소화하기 위해 trichloroacetic acid 대신 약한 산인 dichloroacetic acid 가 쓰여지기도 한다. Deblocking 시 고형지지체로부터 떨어져 나가는 DMT 양이온은 진한 주황색을 띄는데 이의 흡광도를 통해 올리고 합성 시의 결합효율을 측정하는 데에 이용할 수 있다.

(2) Coupling

Deblocking 과정을 통해 생성된 고형지지체내의 5'-hydroxyl 기는 가해주는 nucleoside phosphoramidite monomer 와 coupling 반응을 통해 원하는 염기서열의 Oligonucleotide 를 합성하게 된다. 이때 사용되는 nucleoside phosphoramidite monomer는 그림2에서 보듯이 염기부분의 amine 기는 보통 benzoyl 기(adenosine, cytidine 경우) 또는 isobutyryl 기로(guanosine 경우) 보호되어 있으며 모든 monomer 는 5’-hydroxyl 기가 DMT로 보호되어 있어 계속되는 결합반응의 연결부분 역할을 하게 된다. <그림 2 참조>

사용되는 phosphoramidite 구조 그 자체로는 상당히 안정되어 있으므로 고형지지체의 5’-hydroxyl 기와 결합하기 위해서는 활성화 과정이 필요하다. 보편적으로 사용되는 activator 로는 tetrazole 로서 phosphoramidite 와 반응하여 nitrogen 부분을 protonation 시킨 뒤 diisopropyl amino 기를 치환시켜 매우 반응성이 강한 tetrazolide구조로 변환시킨다.

결과적으로, 반응성이 강한 tetrazolide와 고형지지체의 5’-hydroxyl기 간의 결합반응을 통해 Oligonucleotide의 phosphite triester 결합이 되는데 이때 약간의 수분이라도 존재하면 반응성이 강한 tetrazolide와 반응하여 원하지 않는 부산물을 생성하여 합성수율을 저하시키기 때문에 coupling과정에서는 무수 조건이 필수적이다..

(3) Oxidation

Phosphoramidite 와 5’-hydroxyl 기의 coupling 과정을 거쳐 생성된 phosphite triester 구조는 더 안정된 phosphate triester로 변환시키는 과정이 필요하게 된다. 이를 위해서는 iodine을 사용한 oxidation 반응이 사용되며 결과적으로 phosphite는 phosphate로 바뀌게 된다.

(4) Capping

Coupling 반응은 정량적으로는 일어나지는 않기 때문에 (보통 >98%) coupling 후 고형지지체에는 반응하지 않은 5'-hydroxyl기가 남아있게 되는데 이런 올리고가 다음 cycle의 coupling 과정에 반응하게 되면, 한 개의 염기가 deletion 된 배열을 갖는 (N-1)mer 를 생성하는 원인이 된다.

이렇게 deletion된 올리고들은 합성완료 후 원하는 Oligonucleotide의 정제를 어렵게 만들기 때문에 이를 제거하는 것이 중요하다. 그래서 coupling 과정 후 반응하지 않은 올리고의 5’-hydroxyl기를 더 이상 반응하지 않게 ‘capping’ 할 필요가 있다. 이를 위해 acetic anhydride와 N-methylimidazole을 사용하여 acetylation시킴으로써 반응하지 않고 남아있는 고형지지체내의 5'-hydroxyl기를 capping시키게 된다.

원하는 길이의 Oligonucleotide의 합성은 상기의 과정들을 반복하여 실시함으로써 이루어지며 합성이 완료되면 최종적으로 ammonia 처리를 하여 합성된 Oligonucleotide를 고형지지체로부터 떼어낸 뒤 정제과정을 거쳐 순수한 Oligonucleotide로 얻게 된다.

Base당 가격 (원)	합성가능한 base수 (mer)	보장량 (nmole)	출고기간 (일)


1,600	130 - 200	0.25 ~ 0.3	7 ~ 8

Modification	가격 (원)
5'-Phosphate	30,000
5'-Biotin	50,000
5'-Amine	30,000
5'-Fluorescein	90,000
5'-Tamra	150,000
Inosine	10,000

공급량 (mg)	가격 (원)	가격 (원)
공급량 (mg)	BioRp	HPLC
50	1,500,000	1,800,000
100	1,750,000	2,100,000
250	2,400,000	2,600,000
500	4,200,000	4,400,000
1,000	6,600,000	6,800,000

DNA Oligo

개요

특장점

◈ Manual

◈ Primer Design Tool

◈ MSDS

◈ Brochure

◈ Quality Assurance

▶ AccuEBQ® Probes

▶ 가격표

▶ EBQ (Excellent Bioneer Quencher)

▶ Combination of Dual Probe

▶ Standard Oligonucleotide

▶ 가격표

▶ 부가서비스 가격표

▶ HT-Oligo™

▶ 가격표

▶ 부가서비스 가격표

▶ Modification Oligos

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▶ 가격표

▶ Modification 가격표

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